Tarsus İdmanyurduspor maçında gördüğü kırmızı kart sonrasında taraftarlarla girdiği diyolag sonrasında büyük bir tepki alan defans oyuncusu ayrılma kararı aldı. Yönetim ve teknik heyet öncelikle Gökhan’ın bu talebini olumsuz karşılarken, Gökhan’ın kesinlik Malatya’da futbol oynamam demesi üzerine yolların ayrıldığı öğrenildi.
2010 – 2011 sezonunun devre arasında Boluspor’dan kiralık olan Yeni Malatyaspor’a gelen Gökhan Sinanoğlu ilk sezon şansız bir sakatlık yaşadı. Pubis sakatlığına yakalanan Gökhan’ın sezon sonunda takımdan ayrılması beklenirken, Gökhan’ın takımda kalmak istediğini ve yönetime bu takımda futbolu bırakmak istiyorum demesi üzerine, o zaman ki Mehmet Emin Katipoğlu başkanlığındaki yönetim futbolcunun gelecek vadeden bir isim olması üzerine tekrar takıma kazandırmıştı. Geçen sezon takımda en az kazananlar listesinde yer alan Gökhan’ın bu sezon yönetimin büyük jestiyle karşılaşarak takımda en fazla kazananlar listesinde yer almıştı.
Bu sezon ise Özcan Kızıltan’ın en çok güvendiği isim olmasına rağmen takımdan ayrılmak istemesi büyük şaşkınlıkla karşılandı.
Oynadığı 3 sezon içerisinde 71 kez Yeni Malatyaspor forması giyen Gökhan Sinanoğlu 7 gol kaydetti.
Bu arada takımdan ayrılışıyla ilgili Ahmet Polat'a ilk açıklamasını yapan Gökhan Sinanoğlu, “Tarsus İdmanyurdu maçında yaşadığım olayda yapmamam gereken bir hareket yaptım. Bunun farkındayım. O maçta, ilk düdükten itibaren kapalı tribünden bizim takıma küfürler ediliyordu. Saha içerisinde bunları net bir şekilde duyabiliyorduk. Bunlar bizi olumsuz yönde etkiliyordu. Benim olayımda ise yediğimiz ikinci golden sonra Maraton tribünden birkaç kişi durmadan bana küfür ediyordu. Ben bunu olgunlukla karşıladım, tepki vermedim. Kırmızı kart yedikten sonra oyundan çıkarken çok kızgındım. Bizim kulübenin arkasında yer taraftarların bir kaçı bana tepki gösterdi. Bende o sinirle onlara tepki verdim. Benim tepki biraz kendime, birazda o birkaç kişiyeydi. Malatyaspor taraftarına kesinlikle tepki vermedim ama benim tepkim öyle algılandı. Eğer kusurum olduysa Malatyaspor taraftarından özür diliyorum. Çünkü ben buraya 3 senedir hizmet ediyorum. Her çıktığım maçta kendi memleketimmiş elimden gelen bütün mücadeleyi verdim. Bu konuda vicdanım oldukça rahat. Ayrılma fikrini tamamen ben aldım” dedi.